Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQY2

2410004P03Rik, RIKEN cDNA 2410004P03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2410004P03RikA0A087WQY2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2410004P03RikA0A087WQY2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2410004P03RikA0A087WQY2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2410004P03RikA0A087WQY2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2410004P03RikA0A087WQY2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2410004P03RikA0A087WQY2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2410004P03RikA0A087WQY2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
2410004P03RikA0A087WQY2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
2410004P03RikA0A087WQY2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
2410004P03RikA0A087WQY2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
2410004P03RikA0A087WQY2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
2410004P03RikA0A087WQY2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2410004P03RikA0A087WQY2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2410004P03RikA0A087WQY2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2410004P03RikA0A087WQY2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2410004P03RikA0A087WQY2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2410004P03RikA0A087WQY2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2410004P03RikA0A087WQY2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2410004P03RikA0A087WQY2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2410004P03RikA0A087WQY2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2410004P03RikA0A087WQY2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2410004P03RikA0A087WQY2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2410004P03RikA0A087WQY2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2410004P03RikA0A087WQY2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2410004P03RikA0A087WQY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2410004P03RikA0A087WQY2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2410004P03RikA0A087WQY2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms