Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC61Q9Y6R9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC61Q9Y6R9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC61Q9Y6R9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC61Q9Y6R9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC61Q9Y6R9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC61Q9Y6R9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms