Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
MAP3K4Q9Y6R4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms