Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD54BQ9Y620 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD54BQ9Y620 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD54BQ9Y620 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms