Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAF8Q9UPN6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAF8Q9UPN6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms