Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNX7Q9UNH6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX7Q9UNH6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX7Q9UNH6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms