Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPA4Q9UI42 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms