Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN8Q9UBY8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms