Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms