Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLIMQ9NVW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLIMQ9NVW2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms