Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PDS5BQ9NTI5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms