Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTA1Q9NP79 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms