Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EBF2Q9HAK2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EBF2Q9HAK2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms