Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx4ipQ9D7Y9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms