Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM175Q9BSA9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM175Q9BSA9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms