Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms