Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YME1L1Q96TA2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YME1L1Q96TA2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms