Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HAPLN3Q96S86 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HAPLN3Q96S86 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms