Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARXQ96QS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms