Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCLT1Q96NL6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms