Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD1Q96MG8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD1Q96MG8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD1Q96MG8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD1Q96MG8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMTD1Q96MG8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCMTD1Q96MG8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMTD1Q96MG8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms