Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EP400Q96L91 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms