Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COG3Q96JB2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG3Q96JB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms