Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC4Q96FT7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC4Q96FT7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms