Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCE1Q969G3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms