Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP205Q92621 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP205Q92621 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms