Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms