Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RB1CC1Q8TDY2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RB1CC1Q8TDY2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms