Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK9Q8TD19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK9Q8TD19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK9Q8TD19 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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