Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC29A4Q7RTT9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms