Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHISA6Q6ZSJ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms