Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNV1Q6PIU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNV1Q6PIU1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNV1Q6PIU1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms