Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRNP1Q6NT89 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRNP1Q6NT89 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRNP1Q6NT89 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms