Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF4Q5VUM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF4Q5VUM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms