Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MYOM3Q5VTT5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYOM3Q5VTT5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MYOM3Q5VTT5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms