Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
AGAP9Q5VTM2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AGAP9Q5VTM2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms