Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH8Q5T0T0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH8Q5T0T0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms