Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6CQ53S08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms