Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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