Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
V1rd19Q3KNP5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
V1rd19Q3KNP5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
V1rd19Q3KNP5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms