Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms