Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP13Q15645 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIP13Q15645 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms