Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MKRN4PQ13434 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN4PQ13434 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN4PQ13434 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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