Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTN1Q12860 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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