Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCB1Q12824 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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