Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HMGXB3Q12766 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
HMGXB3Q12766 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
HMGXB3Q12766 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
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