Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX4Q06945 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX4Q06945 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms