Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 FUN12YAL035W 3009 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 PPQ1YPL179W 1650 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 DOA4YDR069C 2781 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 SRO9YCL037C 1305 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 LCB5YLR260W 2064 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 POL2YNL262W 6669 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 TAF1YGR274C 3201 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 FAT1YBR041W 2010 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 MRPL11YDL202W 750 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 ARD1YHR013C 717 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 CDC12YHR107C 1224 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 NOG1YPL093W 1944 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 COS8YHL048W 1146 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 FLD1YLR404W 858 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 CDC73YLR418C 1182 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 SHH3YMR118C 591 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 RUF21RUF21 707 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 MCK1YNL307C 1128 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 ROD1YOR018W 2514 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 RSC1YGR056W 2787 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YDR282CYDR282C 1245 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YHP1YDR451C 1062 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 SDT1YGL224C 843 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YHR173CYHR173C 339 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 AIM39YOL053W 1188 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YOR186WYOR186W 435 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 SUI3YPL237W 858 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 RAD5YLR032W 3510 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 VPS27YNR006W 1869 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 RRP5YMR229C 5190 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 GAT2YMR136W 1683 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 AIP1YMR092C 1848 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 GWT1YJL091C 1473 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 SSU1YPL092W 1377 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YPR022CYPR022C 3402 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YDL180WYDL180W 1644 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YDL242WYDL242W 354 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 MSW1YDR268W 1140 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 CNN1YFR046C 1086 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 LST7YGR057C 729 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YJL028WYJL028W 336 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 SAS5YOR213C 747 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 YPR077CYPR077C 372 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 RPS9BYBR189W 588 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 PRP3YDR473C 1410 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 LTV1YKL143W 1392 nt2.9□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 NRP1YDL167C 2160 nt2.9□□□□□ -1.94
ATG39Q06159 RCR2YDR003W 633 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 RAI1YGL246C 1164 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 GTF1YGR102C 552 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 AUR1YKL004W 1206 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YBL065WYBL065W 345 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 ASI2YNL159C 870 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 PFA4YOL003C 1137 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 TMC1YOR052C 453 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 MAK21YDR060W 3078 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 RPN1YHR027C 2982 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 ENA5YDR038C 3276 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 RCY1YJL204C 2523 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 SSL1YLR005W 1386 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 GPI1YGR216C 1830 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 UBP12YJL197W 3765 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 SAS4YDR181C 1446 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YGR051CYGR051C 324 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 ERV29YGR284C 933 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 TDA3YHR009C 1572 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YLR049CYLR049C 1287 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YLR225CYLR225C 1224 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YPT7YML001W 627 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 OST6YML019W 999 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 COQ5YML110C 924 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YOL050CYOL050C 321 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YOR338WYOR338W 1092 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 SPO71YDR104C 3738 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 ROM1YGR070W 3468 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 FAR1YJL157C 2493 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 SMC3YJL074C 3693 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 IOC3YFR013W 2364 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 RAD33YML011C 534 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 MED7YOL135C 669 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 HMT1YBR034C 1047 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 PRS5YOL061W 1491 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 KTR6YPL053C 1341 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 NUP85YJR042W 2235 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 SKN7YHR206W 1869 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 GIS4YML006C 2325 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 FAS1YKL182W 6156 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 snR57snR57 88 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 FAP7YDL166C 594 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 CWC2YDL209C 1020 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 RPC11YDR045C 333 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 CPR1YDR155C 489 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 IES6YEL044W 501 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YEL074WYEL074W 339 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YUH1YJR099W 711 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 YMR084WYMR084W 789 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 DDP1YOR163W 567 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 OSW1YOR255W 837 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 BMT2YBR141C 1014 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG39Q06159 POL31YJR006W 1464 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms