Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APBA1Q02410 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms