Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gjb2Q00977 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms